În contextul actual, al unui impact tot mai mare al omului asupra ecosistemelor naturale, devine tot mai important rolul grădinilor botanice în conservarea biodiversității, precum și în educarea și informarea publicului privind importanța plantelor și a pericolelor la care acestea sunt expuse. Programele de educație în sprijinul conservării biodiversității, inițiate la Grădina Botanică A. Borza, s-au îmbinat cu programele de cercetare a speciilor din flora spontană a României, astfel cursanții au putut fi mult mai ușor sensibilizați asupra problemelor și costurilor pe care le implică acțiunile de conservare. Diversitatea programelor de educație ecologică oferite de grădina botanică, de-a lungul timpului, este mare cuprinzând nu doar domeniul plantelor ci și a altor organisme vii.

Dintre aceste programe amintim: Grădina verde de la grădi, Munții Apuseni în Grădina Botanică Alexandru Borza, Scena grădinii botanice, Prietenii naturii, Să învățăm să conservăm Astragalus peterfii, Vânătoare de comori în grădina botanică, Key2nature, Școala altfel în grădina botanică, Noaptea privighetorilor, Noaptea liliecilor, Ziua Plantelor, Ziua Apei, Natura se pregătește de iarnă, Expoziție de bonsai și Expoziție de fluturi vii. Tot în spiritul educării publicului larg asupra valorii unor specii din flora spontană a României, s-a organizat o potecă tematică pe parcursul căreia sunt prezentate specii de plante de importanță ecologică, economică sau rare de la noi din țară.