La collection de graines représente, ensemble avec les autres collections des différents taxons cultivés, la base de l’activité de conservation ex situ du jardin. Elle se compose de graines de diverses espèces récoltées au fil du temps dans le jardin botanique A. Borza ou de la flore spontanée de Roumanie. Les différents échantillons sont classés dans l’ordre phylogénétique (famille, genre, espèce). De cette manière, les graines peuvent être utilisées pour diverses études de morphologie, de germination, d’études biochimiques ou d’analyse moléculaire (ADN).